吐魯番市區的面積不大,多數賓館集中分布在幾條主干道,其中位于南北走向的高昌路和青年路上的酒店有吐魯番大飯店、康泰酒店、鴻遠酒店、吐魯番賓館等,位于東西走向的綠洲路、文化路上的酒店有絲路綠洲賓館、金新賓館。市區唯一一座五星級的賓館吐哈石油大廈也在文化路230號。
除了市區之外,方便住宿的地方還有鄯善縣,主要位于鄯善縣火車站附近,如火車站寶城、金田賓館等。此外,游覽葡萄溝時,可選擇住在溝內的葡萄山莊,不過價格較為昂貴。